Dispersion chez un Oomycete pathogène tellurique
Légende : Zoospore et analyses des trajectoires de nage chez Aphanomyces euteiches, agent pathogène des racines des légumineuses.
DispOOM étudie la dispersion d’Aphanomyces euteiches, oomycète responsable du pourrissement racinaire du pois. Du fait de sa persistance dans le sol et de l’absence de variétés totalement résistantes, ce pathogène cause de fortes pertes et limite la culture du pois en France. La gestion repose sur l’évitement des parcelles à risque et des rotations longues. Les traits écologiques favorisant sa dispersion et leur variabilité sont peu connus. DispOOM utilise des microcosmes pour analyser la dispersion de 30 souches en présence de quatre lignées de pois. Les résultats montrent que la dispersion est (i) variable entre souches, (ii) liée au phénotype des zoospores flagellées et mobiles, (iii) influencée par leur agressivité et (iv) accrue en présence de pois. Les souches ont été séquencées et des analyses transcriptomiques unicellulaires sont en cours. Le projet contribue ainsi à co-construire des solutions concrètes pour renforcer la résilience des systèmes de culture du pois, en dialogue avec les enjeux de réduction des intrants et de santé des agroécosystèmes.
Objectifs de la prolongation
- Alimenter des stratégies de gestion intégrée plus durables, en lien avec les dynamiques du sol et les interactions plante-pathogène
- Tester la capacité de dispersion comme trait sélectionnable, et observer les éventuelles modifications transcriptomiques associées à cette sélection
- Déterminer le potentiel évolutif et les déterminants moléculaires sous-jacents à la dispersion pour comprendre comment les pathogènes colonisent de nouveaux hôtes à l’échelle locale et régionale
- Actions prévues
- Partenaires extra-académique
- Terrains/Zone d’étude
- Scientifiques impliqués
- Valorisations
- Analyser et rédiger les premiers résultats pour valorisation scientifique et diffusion.
- Mettre en place une approche de transcriptomique à l’échelle de la cellule unique (scRNA-seq) pour comparer l’expression génique entre deux phénotypes de zoospores
- Réaliser de la sélection artificielle à chaque cycle de reproduction asexuée pour favoriser les individus les plus dispersants.
- Terres Inovia
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En Occitanie
- Jérôme GOUZY [Bio-informatique], UMR LIPME, INRAE Toulouse
- Baptiste MAYJONADE [Biologie moléculaire], UMR LIPME, INRAE Toulouse
Hors Occitanie
- Marie-Laure PILET-NAYEL [Génétique des plantes], UMR IGEPP, INRAE Angers
Publications
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Communications
- Trinquier M., Gaulin E., Legrand D., Variation in dispersal capacities of a soil-borne oomycete pathogen in response to root exudates, Poster – Rhizosphere 6 Rooting for earth congress, Edinburg, Ecosse, juin 2025.
- Présentation au réseau Rhizosphare : Vers l’identification de profil métabolique d’exsudat racinaire de pois, co-animée avec Guillaume Marti de la plateforme Métatoul-AgromiX
- Présentation au forum du LabEX TULIP 2025
- Présentation au réseau Modip (Molecular dialogue in plant biotic interactions)
A venir
- Publication scientifique, en cours de rédaction, sur les variabilités de dispersion mise en évidence entre les différentes souches d’A. euteiches isolées au champ essentiellement en France mais aussi en Suède, Finlande et aux Etats-Unis
- Publication sur les résultats déjà obtenus et en cours d’obtention en lien avec la variation de dispersion et d’agressivité des différentes souches du pathogène en fonction de la nature de la plante présente dans son environnement (type de légumineuses pois et non-légumineuses)
- Guide de recommandations pour les instituts techniques