OcciPhage

Diversité et emploi de bactériophages à potentiel de lutte biologique contre les bactéries pathogènes de cultures tempérées et tropicales


En agriculture, la lutte chimique est peu efficace et comporte de nombreux inconvénients. Une alternative prometteuse pour améliorer la santé végétale est de recourir aux ennemis naturels des microbes affectant les plantes. Dans ce projet, nous évaluerons le potentiel de parasites de bactéries, les bactériophages, pour lutter contre des maladies de grandes cultures.

Objectifs

  • Identifier des phages parasites de la bactérie Xanthomonas du chou et du manioc​
  • Tester leur potentiel pour assainir des semences infectées​
  • Évaluer l’acceptabilité de cet outil de lutte biologique par les divers acteurs

Principaux résultats attendus

  • Gamme d’hôtes et génome de phages virulents efficaces contre Xanthomonas​
  • Preuve de concept que le traitement de semences par phages est fonctionnel​
  • Structuration d’un réseau de recherche multidisciplinaire sur les phages ​
  • Isolement et caractérisation de phages, évaluation de leur virulence ​
  • Traitement de semences infectées vs saines (en serre)​
  • Enquête et journée d’échanges avec les acteurs
  • PHIM​
  • LIPME​
  • MIVEGEC​
  • UR407​
  • Centre Émile Durkheim​
  • Greenphage (start-up biotech)​
  • CIAT (agronome) et U. los Andes​
  • manioc / chou ​
  • Côte caraïbe Colombienne / Castelnaudary​
  • système semencier traditionnel / industrie semencière​

En Occitanie

  • Carlos ZARATE [microbiologie], PHIM, équipe XPLAIN, IRD Montpellier
  • Boris SZUREK [phytopathologie], PHIM, équipe XPLAIN, IRD Montpellier
  • Alice BOULANGER [microbiologie], LIPME, équipe SIX, Université Paul Sabatier Toulouse
  • Lionel GAGNEVIN [microbiologie, épidémiologie], PHIM, équipe XPlain, CIRAD Montpellier
  • Rémy FROISSART [virologie], MIVEGEC, CNRS Montpellier

Hors d’Occitanie

  • Clara TORRES-BARCELO [virologie], Pathologie Végétale, équipe Mistral, INRAE Avignon
  • Charlotte BRIVES [sociologie], Centre Émile Durkheim UMR : Science politique et sociologie comparatives, équipe Axe SENS Science, ENvironnement, Santé, Université de Bordeaux
  • Adriana BERNAL [microbiologie], Laboratorio de Interacciones Moleculares de Microorganismos
  • Agricolas (LIMMA), Universidad de los Andes, Bogotá, Colombia
  • Michael GOMEZ SELVARAJ [agronomie], Phenomics Platform, CIAT, Cali, Colombia

Financement

Post-doctorat de 12 mois

Post-doc recruté

Carlos Zarate-Chaves, UMR PHIM

Référent

Boris Szurek, UMR PHIM
boris.szurek[a]ird.fr

Mots clés

Élevages agroécologiques, trajectoires, innovation, valeurs, pratiques

Dates de réalisation

01/01/2024
> 31/12/2024

Dimension(s) du Défi Clé

Diversité
Transitions

Tutelles

Porteurs : IRD
Partenaires : CNRS, INRAE